ในการศึกษาที่เกี่ยวข้องซึ่งตีพิมพ์เมื่อวันที่ 26 กรกฎาคม 2022 ทางออนไลน์ผ่านทาง First Release in Scienceนักวิจัยจาก University of California San Diego กับเพื่อนร่วมงานใน 4 ทวีป แสดงให้เห็นว่าต้นกำเนิดของการระบาดใหญ่ของ COVID-19 ในปี 2019 อยู่ที่ Huanan Seafood ตลาดค้าส่งในเมืองหวู่ฮั่น ประเทศจีน และเป็นผลมาจากไวรัส SARS-CoV-2 อย่างน้อยสองครั้งกระโดดจากโฮสต์ของสัตว์ที่มีชีวิตไปสู่คนที่ทำงานหรือซื้อของที่นั่น
ผลการวิจัย ซึ่งรายงานครั้งแรกในเดือนกุมภาพันธ์หลังจากเอกสารถูกโพสต์ทางออนไลน์เป็นงานพิมพ์ที่รอการตรวจสอบ โดยได้รับความสนใจจากนานาประเทศ โดยเน้นที่การระบุตลาดว่าเป็นศูนย์กลางการระบาดของโรคโควิด-19 ในช่วงแรก องค์การอนามัยโลกประเมินว่ามีผู้ป่วยโรคโควิด-19 ที่ได้รับการยืนยันแล้วมากกว่า 566 ล้านรายทั่วโลก และมีผู้เสียชีวิต 6.3 ล้านรายนับตั้งแต่มีการประกาศการระบาดใหญ่ในต้นปี 2563
Joel O. Wertheim, PhD, รองศาสตราจารย์ประจำภาควิชากล่าวว่า “สิ่งสำคัญคือเราต้องรู้เกี่ยวกับต้นกำเนิดของ COVID-19 ให้มากที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้ เพราะการทำความเข้าใจว่าการระบาดใหญ่เริ่มต้นขึ้นได้อย่างไร เราหวังว่าจะสามารถป้องกันพวกเขาได้ในอนาคต” โรคติดเชื้อและสาธารณสุขระดับโลกที่ UC San Diego School of Medicine และผู้เขียนร่วมในเอกสารทั้งสองฉบับ
แต่องค์ประกอบพื้นฐานในการทำความเข้าใจต้นกำเนิดของการระบาดใหญ่นั้นไม่ได้ระบุเพียงแค่ว่าเชื้อโรคสามารถกระโดดจากสัตว์ที่ไม่ใช่มนุษย์ไปสู่มนุษย์ได้อย่างไร เรียกว่าเหตุการณ์จากสัตว์สู่คนได้สำเร็จ
“ฉันคิดว่ามีความเห็นเป็นเอกฉันท์ว่าจริงๆ แล้วไวรัสนี้มาจากตลาดหัวหนาน แต่กรณีที่ชัดเจนสำหรับการแนะนำหลายครั้งยังไม่เกิดขึ้นจากใครอื่น” เวิร์ทไฮม์ ผู้เขียนอาวุโสของการศึกษาซึ่งระบุถึง SARS-CoV กล่าว -2 ไวรัสซึ่งเป็นสาเหตุของ COVID-19 กระโดดจากสัตว์สู่คนอย่างน้อยสองครั้งและอาจมากถึงสองโหล
นักวิจัยระบุว่าไวรัสมีวิวัฒนาการ 2 สาขาในช่วงต้นของการระบาดใหญ่ โดยมีความแตกต่างกันเพียง 2 อย่างในนิวคลีโอไทด์ ซึ่งเป็นองค์ประกอบพื้นฐานของ DNA และ RNA
Lineage B ซึ่งรวมถึงกลุ่มตัวอย่างจากคนที่ทำงานและเยี่ยมชมตลาด กลายเป็นผู้มีอิทธิพลไปทั่วโลก Lineage A แพร่กระจายไปในจีน และรวมตัวอย่างจากคนที่เจาะจงไปยังบริเวณใกล้เคียงตลาด หากไวรัสในสายเลือด A มีวิวัฒนาการมาจากไวรัสในเชื้อสาย B หรือในทางกลับกัน Wertheim กล่าวว่าสิ่งนี้จะแนะนำให้ SARS-CoV-2 เพิ่มขึ้นเพียงครั้งเดียวจากสัตว์สู่คน
แต่งานของ Wertheim และผู้ทำงานร่วมกันพบว่าจีโนม SARS-CoV-2 แรกสุดไม่สอดคล้องกับการกระโดดจากสัตว์สู่คนเพียงครั้งเดียว ในทางกลับกัน การแพร่เชื้อจากสัตว์สู่คนครั้งแรกน่าจะเกิดขึ้นกับไวรัสเชื้อสาย B ในปลายเดือนพฤศจิกายน 2019 ในขณะที่การแพร่เชื้อจากสายเลือด A สู่มนุษย์น่าจะเกิดขึ้นภายในไม่กี่สัปดาห์ของเหตุการณ์แรก ทั้งสองสายพันธุ์มีอยู่ในตลาดพร้อมกัน
นักวิจัยมาถึงข้อสรุปนี้โดยถอดรหัสอัตราการวิวัฒนาการของจีโนมไวรัสเพื่อสรุปว่าสายเลือดทั้งสองแยกจากบรรพบุรุษร่วมกันเพียงคนเดียวในมนุษย์หรือไม่ พวกเขาใช้เทคนิคที่เรียกว่าการวิเคราะห์นาฬิกาโมเลกุลและเครื่องมือจำลองการแพร่ระบาดที่เรียกว่า FAVITES ซึ่งคิดค้นโดยสมาชิกในทีม Wertheim Niema Moshiri, PhD, ผู้ช่วยศาสตราจารย์ด้านวิทยาการคอมพิวเตอร์ที่ Jacobs School of Engineering ที่ UC San Diego และผู้ร่วมวิจัยด้านการศึกษา
“สิ่งนี้ไม่สามารถทำได้หากไม่มี FAVITES” เวิร์ทไฮม์กล่าว
การตรวจสอบความถูกต้อง
ในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2565 นักวิจัยที่ศูนย์ควบคุมและป้องกันโรคแห่งประเทศจีนได้ตีพิมพ์การวิเคราะห์ร่องรอยทางพันธุกรรมของตัวอย่างสิ่งแวดล้อมที่เก็บรวบรวมได้ที่ตลาดเมื่อสองปีก่อนเป็นเวลานาน
ตัวอย่างได้รับหลังจากรายงานครั้งแรกของการเจ็บป่วยลึกลับใหม่และหลังจากที่ตลาดปิดตัวลงแล้ว ตลาดขายส่งอาหารทะเลหัวหนานในหวู่ฮั่นเป็น “ตลาดสด” ที่สัตว์มีชีวิตมักถูกฆ่าและขายเพื่อการบริโภคของมนุษย์ รวมถึงสัตว์ป่าในบางกรณี
อย่างไรก็ตาม ไม่มีสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมในป่าเหลือทิ้งไว้ที่ตลาดหลังจากปิดตัวลง แทนที่จะเป็นเช่นนั้น นักวิจัยชาวจีนก็กวาดผนัง พื้น และพื้นผิวอื่นๆ ทดสอบเนื้อในตู้เย็น สุ่มตัวอย่างท่อระบายน้ำ และจับหนู แมวจรจัด และสุนัขที่อยู่รอบๆ ตลาด
การค้นพบของพวกเขายืนยันการคาดการณ์ที่ยังไม่ได้เผยแพร่ของทีม Wertheim ว่า Lineage A อยู่ที่ตลาดด้วย
“เรารู้สึกว่าได้รับการตรวจสอบแล้ว แต่สิ่งที่เรารู้สึกมากกว่านั้นคือความกดดันมหาศาล เพราะพวกเขาเอาชนะงานพิมพ์ล่วงหน้าของเราจนถึงหมัดได้ประมาณ 12 ชั่วโมง และเราสามารถพูดคุยถึงการค้นพบของพวกเขาในแง่ของเราเท่านั้น” เวิร์ทไฮม์กล่าว “เรายังตกใจที่พวกเขาได้รับหลักฐานสำหรับสายเลือด A ที่ตลาดมานานกว่าหนึ่งปีโดยไม่ได้ตระหนักถึงความสำคัญของมัน”
ผู้เขียนศึกษากล่าวว่าข้อมูลที่ตีพิมพ์ใหม่นี้เป็นหลักฐานอันทรงพลังที่แสดงว่าสายเลือดไวรัสทั้งสองวิวัฒนาการแยกจากกันและเกิดเหตุการณ์การรั่วไหลหลายครั้ง มีรายงานว่าตลาดอู่ฮั่นมีธุรกิจสัตว์ป่าที่มีชีวิตที่แข็งแกร่ง โดยมีงู แบดเจอร์ มัสกัต นก และสุนัขแรคคูน (เป็นสัตว์ประจำถิ่นในทวีปเอเชีย) และสายพันธุ์อื่นๆ ที่ขายเป็นอาหาร Wertheim กล่าวว่าเขาเชื่อว่าน่าจะมีการแนะนำไวรัสมากมาย อย่างน้อยสองคนประสบความสำเร็จในการก้าวกระโดดของสัตว์และมนุษย์ ไวรัสสายพันธุ์อื่นสูญพันธุ์
“ในขณะที่ฉันลังเลที่จะเรียกสิ่งนี้ว่าข้อพิสูจน์ สิ่งที่เรานำเสนอคือคำอธิบายที่ครอบคลุมมากที่สุดสำหรับความหลากหลายทางพันธุกรรมของ SARS-CoV-2 ในช่วงเริ่มต้นของการระบาดใหญ่” เวิร์ทไฮม์กล่าว “ไม่มีคำอธิบายที่ดีจริง ๆ สำหรับทั้งสองสายพันธุ์นี้ในตลาด ยกเว้นการกระโดดเข้าหามนุษย์หลายครั้ง”
(ผลการวิจัยได้ตัดราคาทฤษฎีที่หมุนเวียนและต่อเนื่องว่าไวรัส SARS-CoV-2 หนีออกจากสถาบันไวรัสวิทยาหวู่ฮั่นซึ่งอยู่ห่างจากตลาดเพียงไม่กี่ไมล์)
Jonathan E. Pekar นักศึกษาปริญญาเอกสาขา Bioinformatics and Systems Biology ที่ร่วมเป็นผู้นำโครงการกับ Wertheim และเป็นผู้เขียนนำ กล่าวว่าการระบาดใหญ่นี้น่าจะเกิดขึ้นเป็นเวลาหลายปี โดยรอเฉพาะโอกาสที่มนุษย์จะสัมผัสกับโฮสต์ของสัตว์ สามารถแพร่เชื้อได้
“ทุกอย่างซับซ้อนเกิดขึ้นก่อนการแนะนำนั้น” Pekar กล่าว “ขั้นตอนสุดท้ายเป็นเพียงการขยายการติดต่อและการแพร่กระจายจากโฮสต์สู่มนุษย์ เมื่อถึงจุดนั้น มันไม่ปกติที่จะมีการแนะนำตัวเพียงคนเดียว เราเคยเห็นสิ่งนี้มาก่อนกับ MERS-CoV (ไวรัสจากสัตว์สู่คนที่คล้ายกัน) เราเคยเห็นมันกับมนุษย์ที่มอบ SARS-CoV-2 ให้กับมิงค์ในฟาร์ม แล้วมิงค์ก็คืนมันให้กับมนุษย์
“สิ่งนี้เคยเกิดขึ้นมาก่อนและจะเกิดขึ้นต่อไป ธรรมชาติเป็นห้องทดลองที่ดีกว่าที่มนุษย์เคยเป็นมา”
การศึกษาล่าสุดยังคงเป็นบทความที่ตีพิมพ์โดย Wertheim และเพื่อนร่วมงานที่กำลังสืบสวนและบันทึกประวัติต้นกำเนิดและการแพร่กระจายของ COVID-19
ใน เดือนกันยายน 2020พวกเขาเผยแพร่ข้อมูลที่อธิบายว่ากรณีแรกของ coronavirus ใหม่เพียงไม่กี่รายในอเมริกาเหนือและยุโรปแพร่กระจายอย่างรวดเร็วเนื่องจากการทดสอบและการติดตามผู้ติดต่อไม่เพียงพอ ใน เดือนมีนาคม พ.ศ. 2564 Wertheim, Pekar และเพื่อนร่วมงานได้ระบุช่วงเวลาสั้น ๆ ในระหว่างที่ SARS-CoV-2 สามารถตรวจพบได้ก่อนที่จะมีผู้ป่วยรายแรกในหวู่ฮั่น
ผู้เขียนร่วมของ “ระบาดวิทยาระดับโมเลกุลของแหล่งกำเนิดจากสัตว์สู่คนหลายตัวของ SARS-CoV-2” ได้แก่ Andrew Magee, Karthik Gangavarapu และ Marc A. Suchard ทั้งหมดที่ UCLA; Edyth Parker, Nathaniel L. Matteson, Mark Zeller, Joshua I. Levy และ Kristian G. Andersen ทั้งหมดที่ The Scripps Research Institute; Katherine Izhikevich, Jennifer L. Havens และ Tetyana I.Vasylyeva ทั้งหมดที่ UC San Diego; Lorena Mariana Malpica Serrano และ Michael Worobey ทั้งคู่ที่ University of Arizona; Alexander Crits-Christoph, โรงเรียนสาธารณสุข Johns Hopkins Bloomberg; Jade C. Wang และ Scott Hughes ทั้งคู่ที่ New York City Department of Health; Jungmin Lee, Heedo Park, Man-Seong Park, มหาวิทยาลัยเกาหลี; Katherine Ching Zi Yan และ Raymond Tzer Pin Lin ทั้งหมดที่ศูนย์โรคติดเชื้อแห่งชาติสิงคโปร์; Mohd Noor Mat Isa และ Yusuf Muhammad Noor, ทั้งที่สถาบันจีโนมมาเลเซียและวัคซีน Robert F. Garry มหาวิทยาลัยทูเลน; Edward C. Holmes, มหาวิทยาลัยซิดนีย์, ออสเตรเลีย; และ Andrew Rambaut มหาวิทยาลัยเอดินบะระ
เงินทุนสำหรับการวิจัยนี้ส่วนหนึ่งมาจากสถาบันสุขภาพแห่งชาติ (ทุน T15LM011271, 5T32AI007244-38, R01AI135992, R01AI136056, R01AI132223, R01AI132244, U19AI142790, U54CA260581, U54HG007480, OT2HL158260, R0119AI153044, U54CA260581, U54HG007480, OT2HL158260, R0119AI153044 มูลนิธิวิทยาศาสตร์ (NSF-2028040), กลุ่มพันธมิตรเพื่อนวัตกรรมการเตรียมพร้อมในการแพร่ระบาด, มูลนิธิ Wellcome Trust, Gilead Sciences, โครงการหุ้นส่วนการทดลองทางคลินิกในยุโรปและประเทศกำลังพัฒนา, สภาวิจัยแห่งยุโรป, สมาคมวิจัยแห่งออสเตรเลีย Laureate Fellowship, มูลนิธิวิจัยแห่งชาติของ เกาหลี, Branco Weiss Fellowship, the Epidemiology and Laboratory Capacity (ELC) for Infectious Diseases Cooperative Agreement and the Centers for Disease Control and Prevention (6NU50CK000517-01-07)
